常総学院高等学校の部活動は、「強化部」と「運動系」と「文化系」の3つにわけられます。強化部のみが特技推薦の対象となります。特待制度が適用される場合もあります。
強化部
運動系
パワーリフティング部
男子バスケットボール部
弓道部
女子バスケットボール部
応援指導部(援慈会)
チアリーダー部
硬式テニス部
ゴルフ部
卓球部
文化系
デジタルファブリケーション部
International Communication Club
演劇部
クッキング部
軽音楽部
JRC部
写真部
書道部
フォークソング部
文芸同好会